因为这本书叫《为生物信息学设计的Python教程》(PythonforBioinformatics),所以在头脑中是基于下面的假设被写出来的:读者应该知道怎样使用计算机。
不需要编程的知识,但是读者需要最低的计算机熟练程度,能够用文本编辑器,处理操作系统(OS)中的基本任务。
由于Python是支持多平台的,这本书的大多数的指令都可以应用到常用的操作系统(Windows,MacOsX和Linux),当一个命令或过程只能应用到特定的操作系统中时,它将被特殊说明。
读者应该正在用生物信息学工具或至少想用它们进行工作,甚至是小规模手动的工作,诸如用NCBI的Blast来识别一个序列,排序蛋白质,引物寻找,或估计系统进化树对重复这里的结果都是有帮助的。
读者对生物信息了解得越多,他就能够应用这些概念来更好地学习本书。
2025/11/29 5:17:38 3.41MB 生物信息  python 二代测序 NGS
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生物信息学的圣经,作为教程值得一度Suitableforadvancedundergraduatesandpostgraduates,UnderstandingBioinformaticsprovidesadefinitiveguidetothisvibrantandevolvingdiscipline.Thebooktakesaconceptualapproach.Itguidesthereaderfromfirstprinciplesthroughtoanunderstandingofthecomputationaltechniquesandthekeyalgorithms.UnderstandingBioinformaticsisaninvaluablecompanionforstudentsfromtheirfirstencounterwiththesubjectthroughtomoreadvancedstudies.Thebookisdividedintosevenparts,withtheopeningpartintroducingthebasicsofnucleicacids,proteinsanddatabases.Subsequentpartsaredividedinto'Applications'and'Theory'Chapters,allowingreaderstofocustheirattentioneffectively.Ineachsection,theApplicationsChapterprovidesafastandstraightforwardroutetounderstandingthemainconceptsand'gettingstarted'.EachoftheseisthenfollowedbyTheoryChapterswhichgivegreaterdetailandpresenttheunderlyingmathematics.InPart2,SequenceAlignments,theApplicationsChaptershowsthereaderhowtogetstartedonproducingandanalyzingsequencealignments,andusingsequencesfordatabasesearching,whilethenexttwochapterslookcloselyatthemoreadvancedtechniquesandthemathematicalalgorithmsinvolved.Part3coversevolutionaryprocessesandshowshowbioinformaticscanbeusedtohelpbuildphylogenetictrees.Part4looksatthecharacteristicsofwholegenomes.InParts5and6thefocusturnstosecondaryandtertiarystructure–predictingstructuralconformationandanalysingstructure-functionrelationships.Thelastpartsurveysmethodsofanalyzingdatafromasetofgenesorproteinsofanorganismandisroundedoffwithanoverviewofsystemsbiology.ThewritingstyleofUnderstandingBioinformaticsisnotableforitsclarity,whiletheextensive,full-colorartworkhasbeendesignedtopresentthekeyconceptswithsimplicityandconsistency.Eachchapterusesmind-mapsandfl
2025/9/20 19:12:52 41.29MB 生物信息学
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可以查找基因序列以及做一些有关基因的东西,该软件主要用于生物信息相关分析。
主要功能包括序列批量提取、转存、转录组富集分...TBtools-生物信息分析是一种很实用的工具
2025/7/5 4:30:06 51.59MB TBTOOL
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标题输出CanvasXpressR库html_document独立的canvasXpress是百时美施贵宝公司开发的用于生物信息学和系统生物学分析的核心可视化组件。
它支持大量的以显示科学和非科学数据。
canvasXpress还包括用于浏览复杂数据集的简单,简洁的,用于跟踪可目的的所有用户自定义的复杂而独特的机制,以及用于同步选定数据点的“开箱即用”广播功能。
页面中的所有canvasXpress图。
可以轻松地对数据进行排序,分组,转置,转换或动态聚类。
完全可定制的鼠标事件以及缩放,平移和拖放功能是使此库在其类中独一无二的功能。
现在,canvasXpress可以简单地
2025/1/6 7:05:45 1.75MB visualization javascript chart bioinformatics
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Galaxy系统的介绍。
生物信息可视化管理系统
2024/12/30 10:33:50 1.94MB Galaxy系统
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同源搜索是生物信息学在分子生物学,蛋白质功能分析和药物开发领域的巨大应用。
为了在不断增长的数据库中执行批量搜索,基本方法是对每个原始查询运行Blast或通过将它们分组在一起来串联查询。
本文提出了一种增强的具有序列压缩和聚类的蛋白质同源性批量搜索算法(C2-BLASTP),该算法利用了查询序列和数据库之间的联合信息。
在C2-BLASTP中,查询和数据库首先通过冗余分析进行压缩。
然后根据子序列相似度对数据库进行聚类。
此后,可以在群集数据库中实现命中查找。
此外,基于潜在的命中结果来重建最终执行数据库,以减轻序列数据库不断扩大的规模。
最后,在执行数据库中进行同源批搜索。
在NCBINR数据库上进行的实验证明,在同源性准确性,搜索速度和内存使用方面,C2-BLASTP对于同源性批量搜索的有效性。
2024/12/12 13:14:20 256KB 研究论文
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生物信息学:序列和基因组分析(Bioinformatics:SequenceandGenome英文版
2024/7/20 18:32:47 5.64MB 生物信息学 序列 基因组
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生物信息学算法导论,英文原版an-introduction-to-bioinformatics-algorithms,有需要的可以下载
2024/7/5 0:13:14 3.18MB an-introduct
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生物信息学专用分析软件Megan的使用说明书手册。
非常好用。
2024/6/12 14:45:37 329KB Megan bioinformati
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利用R语言编写的聚类分析、PCA算法的实现以及应用,用于生物信息学领域的数据分析,有助于R语言与生物信息数据处理的入门有帮助!包含数据集(.txt)
2024/3/31 12:06:39 1.86MB PCA R语言
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在日常工作中,钉钉打卡成了我生活中不可或缺的一部分。然而,有时候这个看似简单的任务却给我带来了不少烦恼。 每天早晚,我总是得牢记打开钉钉应用,点击"工作台",再找到"考勤打卡"进行签到。有时候因为工作忙碌,会忘记打卡,导致考勤异常,影响当月的工作评价。而且,由于我使用的是苹果手机,有时候系统更新后,钉钉的某些功能会出现异常,使得打卡变得更加麻烦。 另外,我的家人使用的是安卓手机,他们也经常抱怨钉钉打卡的繁琐。尤其是对于那些不太熟悉手机操作的长辈来说,每次打卡都是一次挑战。他们总是担心自己会操作失误,导致打卡失败。 为了解决这些烦恼,我开始思考是否可以通过编写一个全自动化脚本来实现钉钉打卡。经过一段时间的摸索和学习,我终于成功编写出了一个适用于苹果和安卓系统的钉钉打卡脚本。
2024-04-09 15:03 15KB 钉钉 钉钉打卡