事实证明，下一代测序（NGS）是描绘多种癌症分子亚型的强大工具，并且可以揭示整个癌症进展过程中基因组突变的积累。
使用深度测序技术从喉鳞状细胞癌（LSCC）患者获得全基因组microRNA（miRNA）和mRNA表达谱，并通过综合计算方法进行分析。
大量蛋白质编码和非编码基因被检测到差异表达，表明LSCC细胞中的功能转换。
总共检测到127个突变基因与外胚层和表皮发育显着相关。
发现有11种miRNA差异表达，其中包括潜在的癌症抑制miRNAmir-34c，其表达明显下调。
对mRNA和miRNA转录组的综合分析进一步揭示了11个miRNA和138个靶向基因之间的相关动力学，从而形成了对LSCC发育的高度动态的共调节网络响应。
使用深度测序技术从喉鳞状细胞癌（LSCC）患者获得全基因组microRNA（miRNA）和mRNA表达谱，并通过综合计算方法进行分析。
大量蛋白质编码和非编码基因被检测到差异表达，表明LSCC细胞中的功能转换。
总共检测到127个突变基因与外胚层和表皮发育显着相关。
发现有11种miRNA差异表达，其中包括潜在的癌症抑制miRNAmir-34c，其表达明显下调。
对mRNA和miRNA转录组的综合分析进一步揭示了11个miRNA和138个靶向基因之间的相关动力学，从而形成了对LSCC发育的高度动态的共调节网络响应。
2025/4/10 0:25:33
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同源搜索是生物信息学在分子生物学，蛋白质功能分析和药物开发领域的巨大应用。
为了在不断增长的数据库中执行批量搜索，基本方法是对每个原始查询运行Blast或通过将它们分组在一起来串联查询。
本文提出了一种增强的具有序列压缩和聚类的蛋白质同源性批量搜索算法（C2-BLASTP），该算法利用了查询序列和数据库之间的联合信息。
在C2-BLASTP中，查询和数据库首先通过冗余分析进行压缩。
然后根据子序列相似度对数据库进行聚类。
此后，可以在群集数据库中实现命中查找。
此外，基于潜在的命中结果来重建最终执行数据库，以减轻序列数据库不断扩大的规模。
最后，在执行数据库中进行同源批搜索。
在NCBINR数据库上进行的实验证明，在同源性准确性，搜索速度和内存使用方面，C2-BLASTP对于同源性批量搜索的有效性。
为了在不断增长的数据库中执行批量搜索，基本方法是对每个原始查询运行Blast或通过将它们分组在一起来串联查询。
本文提出了一种增强的具有序列压缩和聚类的蛋白质同源性批量搜索算法（C2-BLASTP），该算法利用了查询序列和数据库之间的联合信息。
在C2-BLASTP中，查询和数据库首先通过冗余分析进行压缩。
然后根据子序列相似度对数据库进行聚类。
此后，可以在群集数据库中实现命中查找。
此外，基于潜在的命中结果来重建最终执行数据库，以减轻序列数据库不断扩大的规模。
最后，在执行数据库中进行同源批搜索。
在NCBINR数据库上进行的实验证明，在同源性准确性，搜索速度和内存使用方面，C2-BLASTP对于同源性批量搜索的有效性。
2024/12/12 13:14:20
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BioinformaticswithRCookbook.包括如何用R分析microarray，RNA-seq，GWAS,NGS数据，分析蛋白质和核酸序列等等
2024/12/9 3:53:36
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蛋白质相互作用网络中求解BetweennessCentrality的简单方法，用C++实现，需改进
2024/9/20 8:30:40
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dailyFitAPI:gear:...正在开发中目前正处于非常早期的发展阶段。
:notebook_with_decorative_cover:关于节点API。
旨在方便饮食，计算白天的总卡路里，蛋白质，碳水化合物和脂肪的摄入量，并保留该数据的历史记录。
受MyFitnessPal等应用程序启发。
这是一个独立的个人项目，没有任何商业动机。
主要目的是练习和玩乐；
）。
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旨在方便饮食，计算白天的总卡路里，蛋白质，碳水化合物和脂肪的摄入量，并保留该数据的历史记录。
受MyFitnessPal等应用程序启发。
这是一个独立的个人项目，没有任何商业动机。
主要目的是练习和玩乐；
）。
2024/8/1 17:16:07
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难得的中文教程省去了啃英文的时间这个教程为新用户介绍了VMD的用法。
老用户也可以用本教程进一步熟悉程序的应用，以更好地利用VMD。
本教程是针对VMD1.8.3设计的，需要约3个小时来完成。
本教程新增的内容可用三个独立的单元讲解。
第一个单元主要内容是分子图形表现方法基础，还会介绍制作形象逼真的图像要了解的知识。
另外的两个单元是针对高级用户，介绍了VMD的脚本。
尽管非技术性用户可以略去脚本的阅读，但是我们鼓励每个人都去试一试着读一下，因为它会提供一些有力而易用的工具，这些工具是简单的图形用户界面所无法提供的。
本教程以一种有趣的小蛋白质泛素的研究为例来说明VMD的应用。
在本文中，一些资料是在小框中出现的。
这些小框中包括教程的补充内容，例如泛素扮演的生物学角色，使用VMD的一些提示和捷径等等
老用户也可以用本教程进一步熟悉程序的应用，以更好地利用VMD。
本教程是针对VMD1.8.3设计的，需要约3个小时来完成。
本教程新增的内容可用三个独立的单元讲解。
第一个单元主要内容是分子图形表现方法基础，还会介绍制作形象逼真的图像要了解的知识。
另外的两个单元是针对高级用户，介绍了VMD的脚本。
尽管非技术性用户可以略去脚本的阅读，但是我们鼓励每个人都去试一试着读一下，因为它会提供一些有力而易用的工具，这些工具是简单的图形用户界面所无法提供的。
本教程以一种有趣的小蛋白质泛素的研究为例来说明VMD的应用。
在本文中，一些资料是在小框中出现的。
这些小框中包括教程的补充内容，例如泛素扮演的生物学角色，使用VMD的一些提示和捷径等等
2024/7/18 11:07:17
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Pajek是大型复杂网络分析工具，是用于研究目前所存在的各种复杂非线性网络的有力工具。
Pajek向以下网络提供分析和可视化操作工具:合著网、化学有机分子、蛋白质受体交互网、家谱、因特网、引文网、传播网(AIDS、新闻、创新)、数据挖掘(2-mode网)等。
Pajek向以下网络提供分析和可视化操作工具:合著网、化学有机分子、蛋白质受体交互网、家谱、因特网、引文网、传播网(AIDS、新闻、创新)、数据挖掘(2-mode网)等。
2024/7/3 22:29:23
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蛋白质的磷酸化是重要的翻译后修饰，可激活信号通路中包括的各种酶和受体。
为了减少通过费力的实验来鉴定磷酸化位点的成本，已经积极研究了其计算预测。
在这项研究中，通过采用一组新的特征，并在通过支持向量机进行训练之前，通过随机森林在网格搜索中应用特征选择，我们的方法对两个不同的数据集实现了更好或相当的磷酸化位点预测性能。
为了减少通过费力的实验来鉴定磷酸化位点的成本，已经积极研究了其计算预测。
在这项研究中，通过采用一组新的特征，并在通过支持向量机进行训练之前，通过随机森林在网格搜索中应用特征选择，我们的方法对两个不同的数据集实现了更好或相当的磷酸化位点预测性能。
2024/6/4 10:25:08
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可以根据个人身高、体重、年龄、活动强度，确定相应的每日所需摄入的能量、蛋白质、脂肪、钠、碳水化合物等营养成分数量。
2024/5/2 7:02:49
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导入部分：【情景引入】小一班的亮亮在刚入园时体质较差，面色苍白，唇、指甲无血色，精神萎靡，食欲不振。
在教师的提醒下，家长将亮亮送去医院检查，发现亮亮患轻度贫血症。
经医生指点，教师和家长在亮亮的饮食中添加了含铁、蛋白质和维生素C含量丰富的食物，如菠菜、鸡蛋、番茄、橙子等。
一段时间后，亮亮的贫血症竟然消失了。
为什么要在亮亮的饮食中添加含铁、蛋白质和维生素Ｃ含量丰富的食物？基本部分：一、营养1.营养素
在教师的提醒下，家长将亮亮送去医院检查，发现亮亮患轻度贫血症。
经医生指点，教师和家长在亮亮的饮食中添加了含铁、蛋白质和维生素C含量丰富的食物，如菠菜、鸡蛋、番茄、橙子等。
一段时间后，亮亮的贫血症竟然消失了。
为什么要在亮亮的饮食中添加含铁、蛋白质和维生素Ｃ含量丰富的食物？基本部分：一、营养1.营养素
2023/11/27 1:30:47
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在日常工作中，钉钉打卡成了我生活中不可或缺的一部分。然而，有时候这个看似简单的任务却给我带来了不少烦恼。
每天早晚，我总是得牢记打开钉钉应用，点击"工作台"，再找到"考勤打卡"进行签到。有时候因为工作忙碌，会忘记打卡，导致考勤异常，影响当月的工作评价。而且，由于我使用的是苹果手机，有时候系统更新后，钉钉的某些功能会出现异常，使得打卡变得更加麻烦。
另外，我的家人使用的是安卓手机，他们也经常抱怨钉钉打卡的繁琐。尤其是对于那些不太熟悉手机操作的长辈来说，每次打卡都是一次挑战。他们总是担心自己会操作失误，导致打卡失败。
为了解决这些烦恼，我开始思考是否可以通过编写一个全自动化脚本来实现钉钉打卡。经过一段时间的摸索和学习，我终于成功编写出了一个适用于苹果和安卓系统的钉钉打卡脚本。
2024-04-09 15:03
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