通过加权组合基于序列的特征并增强多个SVM来预测蛋白质-DNA结合残基
2023/9/4 2:14:54 512KB 研究论文
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非酒精性脂肪肝疾病(NAFLD)的特征是大量脂质滴(LDs)积聚。
这项研究的目的是确定17β-羟类固醇脱氢酶13(17beta-HSD13)在我们的肝脏组织学正常且具有简单脂肪变性的人类受试者中新近鉴定出的LD相关蛋白之一在NAFLD发育中的功能。
从21例人类肝脏活组织检查样本中分离出来,包括9例肝组织学正常的患者(第1组)和12例单纯脂肪变性的患者(第2组)。
通过2DLC-MS/MS测定了来自第1组或第2组的三个肝脏样品的LD相关蛋白的完整集合。
通过比较有或没有NAFLD的受试者之间的LD相关蛋白谱,在NAFLD患者中发现了54个上调的LD相关蛋白和35个下调的LD相关蛋白。
其中,17β-HSD13代表以前未鉴定的LD相关蛋白,在NAFLD中有明显的上调。
由于17β-HSD家族在脂质代谢中起着重要作用,因此选择17β-HSD13来验证蛋白质组学发现并探索其在NAFLD发病机理中的作用。
在db/db(糖尿病)和高脂饮食喂养的小鼠中证实了肝17β-HSD13的增加及其LD表面的位置。
腺病毒介导的人17β-HSD13肝过度表达在C57BL/6小鼠中诱导了脂肪肝
2023/7/8 13:54:30 1.62MB lipogenesis; SCDR9; HSDI7 beta
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氨基酸符号序列转换为FASTA格式的蛋白质序列,直接编译,将英文氨基酸序列粘贴到窗口,按回车即可输出转换结果。
2023/6/1 8:35:29 2KB FASTA 生物信息 蛋白质序列
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在Jupyter笔记本中编写和共享计算分析的十个简单规则该存储库是对及其预印本浏览以下示例笔记本,了解十个简单规则的应用。
此外,我们还建立了以众包更多技术和深入的教程,并紧跟快速发展的Jupyter生态系统。
我们鼓励您贡献并分享您的专业知识。
例子1本示例演示了使用机器学习方法预测蛋白质折叠分类的可重现的4步工作流程。
规则9:设计笔记本以供阅读,运行和浏览。
下面的nbviewer链接提供笔记本电脑和笔记本电脑的非交互式预览。
按钮使用Binder()服务器在Web浏览器中启动JupyterNotebook或JupyterLab(可能很慢!)。
(请参阅Binder网站如何设置到Git存储库的链接。
)HTML链接提供了笔记本的永久静态记录。
也可以从0-Workflow.ipynb顶级笔记本中的链接直接启动所有笔记本。
NbviewerJupyter笔记本Jupyter实验室HTML规则8:共享和解释您的数据。
为了实现可反复性,我们提供了example1/data目录,其中包含运行工作流程所需的所有数据。
该数据与下载位置和下载日期
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Pajek是大型复杂网络分析工具,是用于研究目前所存在的各种复杂非线性网络的有力工具。
Pajek在Windows环境下运行,用于带上千乃至数百万个结点大型网络的分析和可视化操作。
在斯洛文尼亚语中Pajek是蜘蛛的意思。
析和可视化操作工具:合著网、化学有机分子、蛋白质受体交互网、家谱、因特网、引文网、传播网(AIDS、旧事、创新)、数据挖掘(2-mode网)等。
设计Pajek的主要目的:这是最新Pajek64位版本免费获取,仅限于非商业用途。
Pajek向以下网络提供分●支持将大型网络分解成几个较小的网络,以便使用更有效的方法进一步处理;
●向使用者提供一些强大的可视化操作工具;
●执行分析大型网络有效算法(subquadratic)。
通过Pajek可完成以下工作:●在一个网络中搜索类(组成、重要结点的邻居、核等);
●获取属于同一类的结点,并分别显示出来,或者反映出结点的连接关系(更具体的局域视角);
●在类内收缩结点,并显示类之间的关系(全局视角)。
除普通网络(有向、无向、混合网络)外,Pajek还支持多关系网络,2-mode网络(二分(二值)图-网络由两类异质结点构成),以及暂时性网络(动态图—网络随时间演化)。
2015/8/21 4:40:46 10.44MB Pajek
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一个专业软件,用于阐发蛋白质CD色谱,也是一款拟合软件
2016/11/25 4:28:45 3.11MB CD色谱分析
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深度学习预测RBP的研讨文章,详细描述了利用tensorflow搭建深度学习网络预测RNA结合蛋白质
2020/3/13 23:22:57 1.42MB RBP deep l bioinf
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深度学习预测RBP的研讨文章,详细描述了利用tensorflow搭建深度学习网络预测RNA结合蛋白质
2020/11/6 17:07:42 1.42MB RBP deep l bioinf
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我的所有存储库都集中在一个地方,分类后便于查看目录储存库简历制造人#叉子#叉数据集#fork#存档#fork深租#私人#私人#私人论文专为我的实验室而设计。
基本的GUI,可将原始动态自行车文件转换为Matlab熵脚本可以读取的格式。
包括基本描述性统计信息。
计算每个Noraxon记录的熵计算帕金森装置的原始输出的熵Homserver配置备份我的家庭助理配置文件我的家庭服务器的详细信息ML资源#fork#叉里个人的我的背包物品的日志专案#叉计算零食/粉的蛋白质含量,以轻松比较价格和营养WebGUI刮擦Cookpad,未维护Covid仪表板,包含预制图,自己构建的图和数据集浏览#存档Covid仪表板与预制地块在Coursera,Dataquest,Datacamp和其他网站上学习的同时,完成了各种项目#
2020/11/26 21:58:26 46KB
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Pajek是大型复杂网络分析工具,是用于研究目前所存在的各种复杂非线性网络的有力工具。
Pajek在Windows环境下运行,用于带上千乃至数百万个结点大型网络的分析和可视化操作。
在斯洛文尼亚语中Pajek是蜘蛛的意思。
析和可视化操作工具:合著网、化学有机分子、蛋白质受体交互网、家谱、因特网、引文网、传播网(AIDS、旧事、创新)、数据挖掘(2-mode网)等。
设计Pajek的主要目的:这是最新Pajek64位版本免费获取,仅限于非商业用途。
Pajek向以下网络提供分●支持将大型网络分解成几个较小的网络,以便使用更有效的方法进一步处理;
●向使用者提供一些强大的可视化操作工具;
●执行分析大型网络有效算法(subquadratic)。
通过Pajek可完成以下工作:●在一个网络中搜索类(组成、重要结点的邻居、核等);
●获取属于同一类的结点,并分别显示出来,或者反映出结点的连接关系(更具体的局域视角);
●在类内收缩结点,并显示类之间的关系(全局视角)。
除普通网络(有向、无向、混合网络)外,Pajek还支持多关系网络,2-mode网络(二分(二值)图-网络由两类异质结点构成),以及暂时性网络(动态图—网络随时间演化)。
2017/7/19 18:34:04 15.8MB pajek
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在日常工作中,钉钉打卡成了我生活中不可或缺的一部分。然而,有时候这个看似简单的任务却给我带来了不少烦恼。 每天早晚,我总是得牢记打开钉钉应用,点击"工作台",再找到"考勤打卡"进行签到。有时候因为工作忙碌,会忘记打卡,导致考勤异常,影响当月的工作评价。而且,由于我使用的是苹果手机,有时候系统更新后,钉钉的某些功能会出现异常,使得打卡变得更加麻烦。 另外,我的家人使用的是安卓手机,他们也经常抱怨钉钉打卡的繁琐。尤其是对于那些不太熟悉手机操作的长辈来说,每次打卡都是一次挑战。他们总是担心自己会操作失误,导致打卡失败。 为了解决这些烦恼,我开始思考是否可以通过编写一个全自动化脚本来实现钉钉打卡。经过一段时间的摸索和学习,我终于成功编写出了一个适用于苹果和安卓系统的钉钉打卡脚本。
2024-04-09 15:03 15KB 钉钉 钉钉打卡